Cuadros de clasificación
Los fondos documentales del Archivo General se estructuran en un cuadro de clasificación que, dada su diversidad, se articula en dos fondos diferentes: Fomento y Vivienda. En breve, publicaremos dos cuadros, el orgánico-funcional y nuestra adaptación al de funciones de la Administración General del Estado.

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Carreteras
- Estudios y Proyectos
- Explotación y Gestión de Red
- Coordinación y Gestión Administrativa
- Conservación
- Infraestructuras
- Subdelegación del Gobierno en las Sociedades Concesionarias de Autopistas Nacionales de Peaje
- Construcción
- Conservación y Explotación
- Proyectos
- Construcción y Explotación
- Secretaría General
- Inspección y Obras
- Planificación
- Sección de Contratación
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Ferrocarriles
- Transporte por cable
- Transporte por tubería
- Grupos de trabajo
- Grupo de trabajo de coordinación técnica de los transportes por cable
- Grupo de trabajo de coordinación técnica de los transportes por cable
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Obras hidráulicas
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Personal
- Recursos Humanos
- Administración y Gestión Financiera
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Puertos
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Servicios Generales
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Subsecretaría
- Programación Económica
- Información y Comunicación
- Gestión de Ayudas, Subvenciones y Proyectos
- Administración y Gestión Financiera
- Gabinete Técnico
- Centro de Estudios de Ordenación del Territorio y Medio Ambiente
- Instituto del Territorio y Urbanismo
- Área de Patrimonio
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Oficialía Mayor
- Gabinete Telegráfico
- Patrimonio
- Registro General
- Subdirección Adjunta
- Suministros
- Centro de Educación Infantil
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Transporte Terrestre
- Gestión, Análisis e Innovación del Transporte Terrestre
- Administración y Servicios
- Servicios Generales
- Transportes Internacionales
- Inspección de Transporte Terrestre
- Tasas
- Servicio Internacional de Mercancías
- Presupuestos, Contratación y Asuntos Generales
- Transportes por Carretera
- Gestión del Transporte por Carretera
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Colecciones
- Planos
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Aviación Civil
- Transporte Aéreo
- Aeropuertos y Navegación Aérea
- Aviación Civil
- Gestión de Recursos Humanos
- Explotación del Transporte Aéreo
- Navegación Aérea y Aeroportuarios
- Control del Transporte Aéreo
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Secretaría General Técnica
- Responsabilidad Patrimonial
- Recursos
- Normativa y Estudios Técnicos
- Vicesecretaría General Técnica
- Proyectos
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Agencia Estatal de Seguridad Aérea
- Secretaría General
- División Económico-Financiera
- Asesoría Jurídica
- Dirección de Seguridad de Aviación Civil y Protección al Usuario
- División de Calidad y Protección al Usuario
- Servicio de Licencias a Operadores Aéreos y Servicios Aeroportuarios
- División de Seguridad y Facilitación de la Aviación Civil
- Departamento de Servidumbres Aeronáuticas
- Seguridad de Aeronaves
- División de licencias al personal aeronáutico
- Seguridad de Aeropuertos y Navegación Aérea
- Comisión de Estudio y Análisis de Incidentes de Tránsito Aéreo (CEANITA)
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Órganos colegiados
- Comisión Permanente del Hierro
- Comisión Permanente de Estructuras del Acero
- Subcomisión departamental de convenio único para el personal laboral
- Comisión Interministerial de Informática
- Comisión Interterritorial de Cooperación para el Desarrollo
- Comisión de Planeamiento y Coordinación del Área Metropolitana de Madrid
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Comunicaciones
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Archivos privados
- Archivo de la Empresa Sager y Woerner